Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBX2P52951 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GBX2P52951 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GBX2P52951 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBX2P52951 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBX2P52951 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBX2P52951 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBX2P52951 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBX2P52951 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBX2P52951 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBX2P52951 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBX2P52951 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX2P52951 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX2P52951 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX2P52951 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX2P52951 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX2P52951 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX2P52951 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX2P52951 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX2P52951 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX2P52951 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX2P52951 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX2P52951 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX2P52951 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX2P52951 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX2P52951 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX2P52951 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX2P52951 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX2P52951 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX2P52951 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX2P52951 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX2P52951 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX2P52951 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX2P52951 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX2P52951 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBX2P52951 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBX2P52951 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GBX2P52951 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GBX2P52951 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GBX2P52951 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GBX2P52951 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GBX2P52951 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBX2P52951 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBX2P52951 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBX2P52951 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GBX2P52951 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX2P52951 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX2P52951 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX2P52951 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX2P52951 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX2P52951 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX2P52951 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX2P52951 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX2P52951 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX2P52951 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GBX2P52951 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBX2P52951 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBX2P52951 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBX2P52951 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GBX2P52951 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBX2P52951 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBX2P52951 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBX2P52951 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBX2P52951 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBX2P52951 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBX2P52951 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GBX2P52951 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GBX2P52951 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBX2P52951 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBX2P52951 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBX2P52951 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBX2P52951 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GBX2P52951 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBX2P52951 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBX2P52951 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBX2P52951 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBX2P52951 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GBX2P52951 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GBX2P52951 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBX2P52951 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBX2P52951 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GBX2P52951 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GBX2P52951 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GBX2P52951 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GBX2P52951 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX2P52951 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX2P52951 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX2P52951 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX2P52951 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GBX2P52951 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX2P52951 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX2P52951 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX2P52951 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX2P52951 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX2P52951 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX2P52951 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX2P52951 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GBX2P52951 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX2P52951 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX2P52951 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms