Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEK4P51957 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEK4P51957 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEK4P51957 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEK4P51957 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEK4P51957 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEK4P51957 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEK4P51957 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NEK4P51957 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NEK4P51957 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NEK4P51957 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEK4P51957 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEK4P51957 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEK4P51957 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEK4P51957 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEK4P51957 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEK4P51957 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEK4P51957 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEK4P51957 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEK4P51957 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEK4P51957 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEK4P51957 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEK4P51957 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEK4P51957 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEK4P51957 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEK4P51957 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEK4P51957 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEK4P51957 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEK4P51957 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEK4P51957 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEK4P51957 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEK4P51957 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEK4P51957 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEK4P51957 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEK4P51957 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEK4P51957 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEK4P51957 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NEK4P51957 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEK4P51957 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NEK4P51957 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEK4P51957 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEK4P51957 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEK4P51957 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEK4P51957 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEK4P51957 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEK4P51957 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NEK4P51957 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEK4P51957 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NEK4P51957 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEK4P51957 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEK4P51957 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEK4P51957 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NEK4P51957 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEK4P51957 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEK4P51957 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEK4P51957 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEK4P51957 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEK4P51957 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEK4P51957 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEK4P51957 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NEK4P51957 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEK4P51957 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEK4P51957 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEK4P51957 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEK4P51957 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEK4P51957 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEK4P51957 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEK4P51957 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK4P51957 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK4P51957 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK4P51957 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK4P51957 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK4P51957 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK4P51957 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK4P51957 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK4P51957 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEK4P51957 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEK4P51957 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEK4P51957 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEK4P51957 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEK4P51957 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEK4P51957 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEK4P51957 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEK4P51957 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEK4P51957 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEK4P51957 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEK4P51957 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEK4P51957 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEK4P51957 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEK4P51957 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEK4P51957 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEK4P51957 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEK4P51957 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEK4P51957 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEK4P51957 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEK4P51957 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEK4P51957 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NEK4P51957 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEK4P51957 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEK4P51957 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms