Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A2P50993 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP1A2P50993 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP1A2P50993 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms