Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK3P49761 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK3P49761 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK3P49761 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLK3P49761 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLK3P49761 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLK3P49761 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLK3P49761 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLK3P49761 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLK3P49761 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLK3P49761 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLK3P49761 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLK3P49761 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLK3P49761 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK3P49761 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLK3P49761 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK3P49761 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK3P49761 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK3P49761 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK3P49761 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK3P49761 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLK3P49761 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK3P49761 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK3P49761 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK3P49761 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLK3P49761 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLK3P49761 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK3P49761 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLK3P49761 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLK3P49761 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLK3P49761 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK3P49761 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK3P49761 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK3P49761 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLK3P49761 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLK3P49761 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK3P49761 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK3P49761 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK3P49761 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK3P49761 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK3P49761 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK3P49761 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK3P49761 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLK3P49761 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK3P49761 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK3P49761 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK3P49761 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK3P49761 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK3P49761 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK3P49761 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK3P49761 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK3P49761 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK3P49761 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK3P49761 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK3P49761 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK3P49761 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK3P49761 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK3P49761 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK3P49761 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK3P49761 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK3P49761 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK3P49761 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK3P49761 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK3P49761 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK3P49761 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK3P49761 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK3P49761 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK3P49761 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK3P49761 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK3P49761 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK3P49761 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK3P49761 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK3P49761 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK3P49761 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK3P49761 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK3P49761 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK3P49761 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK3P49761 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK3P49761 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK3P49761 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK3P49761 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK3P49761 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK3P49761 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLK3P49761 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK3P49761 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK3P49761 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK3P49761 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK3P49761 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLK3P49761 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK3P49761 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK3P49761 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK3P49761 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK3P49761 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK3P49761 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK3P49761 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK3P49761 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK3P49761 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK3P49761 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK3P49761 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLK3P49761 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms