Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC1P48547 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC1P48547 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC1P48547 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms