Protein–RNA interactions for Protein: P48378

RFX2, DNA-binding protein RFX2, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX2P48378 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX2P48378 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RFX2P48378 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RFX2P48378 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RFX2P48378 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RFX2P48378 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX2P48378 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX2P48378 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX2P48378 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX2P48378 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RFX2P48378 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX2P48378 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX2P48378 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RFX2P48378 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RFX2P48378 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX2P48378 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX2P48378 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RFX2P48378 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX2P48378 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX2P48378 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX2P48378 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX2P48378 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RFX2P48378 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX2P48378 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RFX2P48378 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX2P48378 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX2P48378 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX2P48378 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX2P48378 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX2P48378 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFX2P48378 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFX2P48378 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFX2P48378 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFX2P48378 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFX2P48378 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFX2P48378 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFX2P48378 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFX2P48378 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFX2P48378 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFX2P48378 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFX2P48378 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFX2P48378 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFX2P48378 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFX2P48378 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFX2P48378 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFX2P48378 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFX2P48378 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFX2P48378 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFX2P48378 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFX2P48378 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFX2P48378 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFX2P48378 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFX2P48378 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFX2P48378 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFX2P48378 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFX2P48378 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFX2P48378 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFX2P48378 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFX2P48378 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFX2P48378 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RFX2P48378 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFX2P48378 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RFX2P48378 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFX2P48378 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFX2P48378 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFX2P48378 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFX2P48378 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFX2P48378 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFX2P48378 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RFX2P48378 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFX2P48378 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFX2P48378 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFX2P48378 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFX2P48378 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFX2P48378 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFX2P48378 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFX2P48378 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFX2P48378 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFX2P48378 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFX2P48378 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFX2P48378 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFX2P48378 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFX2P48378 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFX2P48378 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFX2P48378 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFX2P48378 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFX2P48378 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RFX2P48378 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFX2P48378 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFX2P48378 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFX2P48378 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFX2P48378 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFX2P48378 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFX2P48378 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFX2P48378 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFX2P48378 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFX2P48378 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RFX2P48378 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RFX2P48378 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RFX2P48378 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms