Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDKN1BP46527 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN1BP46527 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN1BP46527 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms