Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SYKP43405 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYKP43405 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYKP43405 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYKP43405 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYKP43405 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYKP43405 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SYKP43405 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYKP43405 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYKP43405 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYKP43405 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYKP43405 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYKP43405 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYKP43405 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYKP43405 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYKP43405 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYKP43405 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYKP43405 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYKP43405 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYKP43405 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYKP43405 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYKP43405 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYKP43405 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYKP43405 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYKP43405 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYKP43405 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYKP43405 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SYKP43405 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYKP43405 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYKP43405 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYKP43405 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYKP43405 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYKP43405 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYKP43405 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYKP43405 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYKP43405 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYKP43405 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYKP43405 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SYKP43405 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYKP43405 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYKP43405 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYKP43405 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYKP43405 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYKP43405 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYKP43405 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYKP43405 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYKP43405 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYKP43405 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SYKP43405 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYKP43405 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYKP43405 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYKP43405 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYKP43405 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYKP43405 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYKP43405 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYKP43405 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYKP43405 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYKP43405 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYKP43405 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYKP43405 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYKP43405 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYKP43405 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYKP43405 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYKP43405 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYKP43405 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SYKP43405 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYKP43405 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SYKP43405 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYKP43405 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYKP43405 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYKP43405 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYKP43405 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYKP43405 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYKP43405 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYKP43405 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYKP43405 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYKP43405 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYKP43405 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYKP43405 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYKP43405 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYKP43405 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYKP43405 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYKP43405 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYKP43405 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYKP43405 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYKP43405 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYKP43405 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYKP43405 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYKP43405 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SYKP43405 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYKP43405 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYKP43405 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYKP43405 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYKP43405 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYKP43405 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYKP43405 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYKP43405 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SYKP43405 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYKP43405 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYKP43405 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms