Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR4A2P43354 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR4A2P43354 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR4A2P43354 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms