Protein–RNA interactions for Protein: P40501

AVT7, Vacuolar amino acid transporter 7, yeastyeast

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT7P40501 PTC7YHR076W 1032 nt5.93□□□□□ -1.46
AVT7P40501 CUE4YML101C 354 nt5.93□□□□□ -1.46
AVT7P40501 NOG2YNR053C 1461 nt5.92□□□□□ -1.46
AVT7P40501 PRP2YNR011C 2631 nt5.92□□□□□ -1.46
AVT7P40501 OPI7YDR360W 435 nt5.92□□□□□ -1.46
AVT7P40501 GAL83YER027C 1254 nt5.92□□□□□ -1.46
AVT7P40501 SPG1YGR236C 288 nt5.92□□□□□ -1.46
AVT7P40501 YSC83YHR017W 1158 nt5.92□□□□□ -1.46
AVT7P40501 DYS1YHR068W 1164 nt5.92□□□□□ -1.46
AVT7P40501 CBR1YIL043C 855 nt5.92□□□□□ -1.46
AVT7P40501 RPL31BYLR406C 342 nt5.92□□□□□ -1.46
AVT7P40501 ADE17YMR120C 1779 nt5.92□□□□□ -1.46
AVT7P40501 FMP40YPL222W 2067 nt5.92□□□□□ -1.46
AVT7P40501 UBP13YBL067C 2244 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT7P40501 ADH5YBR145W 1056 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT7P40501 SGE1YPR198W 1632 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT7P40501 IMG1YCR046C 510 nt5.9□□□□□ -1.46
AVT7P40501 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.9□□□□□ -1.46
AVT7P40501 YJR107WYJR107W 987 nt5.9□□□□□ -1.46
AVT7P40501 YKR032WYKR032W 315 nt5.9□□□□□ -1.46
AVT7P40501 LCL3YGL085W 825 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT7P40501 YLR184WYLR184W 348 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT7P40501 MRPL19YNL185C 477 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT7P40501 IRC11YOR013W 471 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT7P40501 VMA2YBR127C 1554 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT7P40501 MRPS28YDR337W 861 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT7P40501 YIP4YGL198W 708 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT7P40501 ASF1YJL115W 840 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT7P40501 YKL153WYKL153W 510 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT7P40501 YLL056CYLL056C 897 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT7P40501 TOS6YNL300W 309 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT7P40501 MRPS18YNL306W 654 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT7P40501 SCS22YBL091C-A 528 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT7P40501 TKL2YBR117C 2046 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT7P40501 YDR415CYDR415C 1125 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT7P40501 TAF9YMR236W 474 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT7P40501 NUP49YGL172W 1419 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT7P40501 NMD5YJR132W 3147 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT7P40501 YHR020WYHR020W 2067 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT7P40501 CRH1YGR189C 1524 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT7P40501 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT7P40501 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT7P40501 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT7P40501 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT7P40501 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT7P40501 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT7P40501 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT7P40501 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT7P40501 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT7P40501 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT7P40501 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT7P40501 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT7P40501 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT7P40501 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT7P40501 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT7P40501 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT7P40501 GLN3YER040W 2193 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT7P40501 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT7P40501 YGL102CYGL102C 429 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT7P40501 FMO1YHR176W 1299 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT7P40501 SMX3YPR182W 261 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT7P40501 ILV6YCL009C 930 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT7P40501 PPM2YOL141W 2088 nt5.84□□□□□ -1.47
AVT7P40501 MIP1YOR330C 3765 nt5.84□□□□□ -1.47
AVT7P40501 YPT1YFL038C 621 nt5.84□□□□□ -1.47
AVT7P40501 YLL058WYLL058W 1728 nt5.84□□□□□ -1.47
AVT7P40501 SAL1YNL083W 1485 nt5.83□□□□□ -1.48
AVT7P40501 PHO3YBR092C 1404 nt5.83□□□□□ -1.48
AVT7P40501 PRI1YIR008C 1230 nt5.83□□□□□ -1.48
AVT7P40501 ATG36YJL185C 882 nt5.83□□□□□ -1.48
AVT7P40501 TMA46YOR091W 1038 nt5.83□□□□□ -1.48
AVT7P40501 YBR113WYBR113W 483 nt5.83□□□□□ -1.48
AVT7P40501 CIR2YOR356W 1896 nt5.83□□□□□ -1.48
AVT7P40501 HEM1YDR232W 1647 nt5.82□□□□□ -1.48
AVT7P40501 GCG1YER163C 699 nt5.82□□□□□ -1.48
AVT7P40501 COX5AYNL052W 462 nt5.82□□□□□ -1.48
AVT7P40501 LSC1YOR142W 990 nt5.82□□□□□ -1.48
AVT7P40501 ICP55YER078C 1536 nt5.82□□□□□ -1.48
AVT7P40501 SES1YDR023W 1389 nt5.81□□□□□ -1.48
AVT7P40501 EDE1YBL047C 4146 nt5.81□□□□□ -1.48
AVT7P40501 MDH1YKL085W 1005 nt5.81□□□□□ -1.48
AVT7P40501 AIM33YML087C 939 nt5.81□□□□□ -1.48
AVT7P40501 YNL200CYNL200C 741 nt5.81□□□□□ -1.48
AVT7P40501 STT3YGL022W 2157 nt5.81□□□□□ -1.48
AVT7P40501 MSC3YLR219W 2187 nt5.81□□□□□ -1.48
AVT7P40501 PMT3YOR321W 2262 nt5.8□□□□□ -1.48
AVT7P40501 MIA40YKL195W 1212 nt5.8□□□□□ -1.48
AVT7P40501 YKR023WYKR023W 1593 nt5.8□□□□□ -1.48
AVT7P40501 RBS1YDL189W 1374 nt5.8□□□□□ -1.48
AVT7P40501 HED1YDR014W-A 489 nt5.79□□□□□ -1.48
AVT7P40501 DFR1YOR236W 636 nt5.79□□□□□ -1.48
AVT7P40501 YPR204WYPR204W 3099 nt5.79□□□□□ -1.48
AVT7P40501 HDA1YNL021W 2121 nt5.78□□□□□ -1.48
AVT7P40501 FBA1YKL060C 1080 nt5.78□□□□□ -1.48
AVT7P40501 SWD1YAR003W 1281 nt5.78□□□□□ -1.48
AVT7P40501 COQ1YBR003W 1422 nt5.78□□□□□ -1.48
AVT7P40501 SEC62YPL094C 825 nt5.78□□□□□ -1.48
AVT7P40501 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt5.77□□□□□ -1.49
AVT7P40501 DRE2YKR071C 1047 nt5.77□□□□□ -1.49
AVT7P40501 RNH1YMR234W 1047 nt5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.5 ms