Protein–RNA interactions for Protein: P40306

PSMB10, Proteasome subunit beta type-10, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB10P40306 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB10P40306 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB10P40306 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB10P40306 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms