Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FEN1P39748 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FEN1P39748 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FEN1P39748 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FEN1P39748 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FEN1P39748 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FEN1P39748 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FEN1P39748 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FEN1P39748 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FEN1P39748 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FEN1P39748 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FEN1P39748 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FEN1P39748 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FEN1P39748 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FEN1P39748 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FEN1P39748 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FEN1P39748 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FEN1P39748 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FEN1P39748 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FEN1P39748 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FEN1P39748 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FEN1P39748 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FEN1P39748 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FEN1P39748 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FEN1P39748 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FEN1P39748 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FEN1P39748 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FEN1P39748 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FEN1P39748 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FEN1P39748 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FEN1P39748 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FEN1P39748 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FEN1P39748 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FEN1P39748 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FEN1P39748 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FEN1P39748 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FEN1P39748 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FEN1P39748 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FEN1P39748 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FEN1P39748 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FEN1P39748 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FEN1P39748 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FEN1P39748 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FEN1P39748 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FEN1P39748 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FEN1P39748 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FEN1P39748 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FEN1P39748 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FEN1P39748 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FEN1P39748 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FEN1P39748 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FEN1P39748 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FEN1P39748 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FEN1P39748 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FEN1P39748 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FEN1P39748 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FEN1P39748 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FEN1P39748 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FEN1P39748 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FEN1P39748 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FEN1P39748 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FEN1P39748 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FEN1P39748 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FEN1P39748 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FEN1P39748 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FEN1P39748 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FEN1P39748 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FEN1P39748 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FEN1P39748 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FEN1P39748 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FEN1P39748 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FEN1P39748 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FEN1P39748 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FEN1P39748 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FEN1P39748 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FEN1P39748 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FEN1P39748 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FEN1P39748 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FEN1P39748 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FEN1P39748 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FEN1P39748 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FEN1P39748 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FEN1P39748 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FEN1P39748 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FEN1P39748 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FEN1P39748 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FEN1P39748 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FEN1P39748 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FEN1P39748 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FEN1P39748 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FEN1P39748 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FEN1P39748 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FEN1P39748 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FEN1P39748 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FEN1P39748 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FEN1P39748 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FEN1P39748 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FEN1P39748 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FEN1P39748 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FEN1P39748 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms