Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLCN1P35523 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CLCN1P35523 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLCN1P35523 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLCN1P35523 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLCN1P35523 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLCN1P35523 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLCN1P35523 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLCN1P35523 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLCN1P35523 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLCN1P35523 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms