Protein–RNA interactions for Protein: P35520

CBS, Cystathionine beta-synthase, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSP35520 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBSP35520 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBSP35520 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBSP35520 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBSP35520 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBSP35520 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBSP35520 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBSP35520 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBSP35520 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBSP35520 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBSP35520 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBSP35520 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBSP35520 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBSP35520 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBSP35520 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBSP35520 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBSP35520 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBSP35520 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBSP35520 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBSP35520 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBSP35520 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBSP35520 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBSP35520 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBSP35520 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBSP35520 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBSP35520 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBSP35520 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBSP35520 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBSP35520 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBSP35520 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBSP35520 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBSP35520 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBSP35520 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBSP35520 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBSP35520 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBSP35520 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBSP35520 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBSP35520 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBSP35520 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBSP35520 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBSP35520 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBSP35520 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBSP35520 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBSP35520 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBSP35520 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBSP35520 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBSP35520 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBSP35520 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBSP35520 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBSP35520 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CBSP35520 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBSP35520 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBSP35520 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBSP35520 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBSP35520 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBSP35520 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBSP35520 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBSP35520 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CBSP35520 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBSP35520 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBSP35520 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBSP35520 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBSP35520 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBSP35520 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBSP35520 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBSP35520 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBSP35520 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBSP35520 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBSP35520 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBSP35520 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBSP35520 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBSP35520 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBSP35520 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBSP35520 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBSP35520 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CBSP35520 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBSP35520 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBSP35520 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CBSP35520 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBSP35520 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBSP35520 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBSP35520 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBSP35520 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CBSP35520 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBSP35520 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CBSP35520 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBSP35520 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBSP35520 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBSP35520 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBSP35520 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBSP35520 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBSP35520 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBSP35520 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CBSP35520 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBSP35520 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBSP35520 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBSP35520 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBSP35520 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CBSP35520 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBSP35520 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms