Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXCR5P32302 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CXCR5P32302 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CXCR5P32302 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms