Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA5P31644 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRA5P31644 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRA5P31644 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRA5P31644 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRA5P31644 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRA5P31644 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms