Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTGFP29279 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTGFP29279 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CTGFP29279 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTGFP29279 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTGFP29279 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTGFP29279 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTGFP29279 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTGFP29279 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTGFP29279 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTGFP29279 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CTGFP29279 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CTGFP29279 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTGFP29279 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTGFP29279 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTGFP29279 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTGFP29279 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTGFP29279 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTGFP29279 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTGFP29279 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTGFP29279 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTGFP29279 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTGFP29279 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTGFP29279 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTGFP29279 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTGFP29279 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTGFP29279 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTGFP29279 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTGFP29279 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTGFP29279 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTGFP29279 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTGFP29279 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTGFP29279 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTGFP29279 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CTGFP29279 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTGFP29279 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTGFP29279 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTGFP29279 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTGFP29279 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTGFP29279 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTGFP29279 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTGFP29279 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTGFP29279 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTGFP29279 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTGFP29279 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CTGFP29279 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CTGFP29279 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTGFP29279 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTGFP29279 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTGFP29279 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTGFP29279 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTGFP29279 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CTGFP29279 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTGFP29279 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTGFP29279 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTGFP29279 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTGFP29279 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTGFP29279 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTGFP29279 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTGFP29279 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTGFP29279 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTGFP29279 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CTGFP29279 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CTGFP29279 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTGFP29279 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTGFP29279 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTGFP29279 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CTGFP29279 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTGFP29279 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTGFP29279 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTGFP29279 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTGFP29279 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTGFP29279 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTGFP29279 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTGFP29279 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTGFP29279 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTGFP29279 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CTGFP29279 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTGFP29279 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTGFP29279 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTGFP29279 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CTGFP29279 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTGFP29279 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTGFP29279 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTGFP29279 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTGFP29279 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTGFP29279 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTGFP29279 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTGFP29279 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTGFP29279 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CTGFP29279 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTGFP29279 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTGFP29279 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTGFP29279 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTGFP29279 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTGFP29279 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTGFP29279 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTGFP29279 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTGFP29279 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTGFP29279 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms