Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM3P25205 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM3P25205 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM3P25205 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM3P25205 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM3P25205 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM3P25205 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM3P25205 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM3P25205 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM3P25205 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM3P25205 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM3P25205 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MCM3P25205 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM3P25205 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM3P25205 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM3P25205 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM3P25205 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM3P25205 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM3P25205 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM3P25205 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM3P25205 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM3P25205 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM3P25205 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM3P25205 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM3P25205 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM3P25205 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM3P25205 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM3P25205 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM3P25205 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM3P25205 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM3P25205 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM3P25205 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM3P25205 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM3P25205 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM3P25205 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM3P25205 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM3P25205 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MCM3P25205 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCM3P25205 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCM3P25205 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCM3P25205 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCM3P25205 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MCM3P25205 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MCM3P25205 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCM3P25205 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCM3P25205 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCM3P25205 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCM3P25205 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCM3P25205 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCM3P25205 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCM3P25205 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCM3P25205 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCM3P25205 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCM3P25205 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCM3P25205 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCM3P25205 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCM3P25205 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCM3P25205 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCM3P25205 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCM3P25205 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCM3P25205 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCM3P25205 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCM3P25205 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MCM3P25205 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCM3P25205 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCM3P25205 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCM3P25205 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MCM3P25205 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM3P25205 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM3P25205 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM3P25205 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCM3P25205 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCM3P25205 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCM3P25205 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MCM3P25205 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCM3P25205 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MCM3P25205 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
MCM3P25205 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM3P25205 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM3P25205 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM3P25205 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM3P25205 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MCM3P25205 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM3P25205 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM3P25205 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM3P25205 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM3P25205 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM3P25205 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM3P25205 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM3P25205 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM3P25205 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM3P25205 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM3P25205 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM3P25205 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM3P25205 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM3P25205 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM3P25205 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM3P25205 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM3P25205 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM3P25205 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms