Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ME2P23368 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME2P23368 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME2P23368 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME2P23368 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME2P23368 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ME2P23368 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME2P23368 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME2P23368 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME2P23368 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME2P23368 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ME2P23368 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME2P23368 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME2P23368 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME2P23368 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME2P23368 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME2P23368 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ME2P23368 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME2P23368 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME2P23368 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME2P23368 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ME2P23368 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME2P23368 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ME2P23368 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ME2P23368 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME2P23368 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME2P23368 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME2P23368 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME2P23368 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME2P23368 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME2P23368 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME2P23368 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ME2P23368 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME2P23368 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME2P23368 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME2P23368 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME2P23368 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME2P23368 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME2P23368 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME2P23368 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME2P23368 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ME2P23368 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ME2P23368 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME2P23368 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME2P23368 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME2P23368 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME2P23368 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME2P23368 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME2P23368 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ME2P23368 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME2P23368 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME2P23368 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME2P23368 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME2P23368 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME2P23368 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME2P23368 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME2P23368 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME2P23368 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ME2P23368 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME2P23368 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME2P23368 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ME2P23368 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME2P23368 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME2P23368 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME2P23368 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME2P23368 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME2P23368 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME2P23368 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ME2P23368 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ME2P23368 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ME2P23368 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME2P23368 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME2P23368 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME2P23368 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME2P23368 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME2P23368 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ME2P23368 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME2P23368 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME2P23368 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ME2P23368 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME2P23368 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME2P23368 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ME2P23368 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME2P23368 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME2P23368 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME2P23368 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME2P23368 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME2P23368 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME2P23368 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME2P23368 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME2P23368 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME2P23368 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME2P23368 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME2P23368 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME2P23368 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME2P23368 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME2P23368 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME2P23368 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME2P23368 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME2P23368 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms