Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN1P21941 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MATN1P21941 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MATN1P21941 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MATN1P21941 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MATN1P21941 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN1P21941 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN1P21941 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN1P21941 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN1P21941 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN1P21941 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN1P21941 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN1P21941 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MATN1P21941 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN1P21941 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN1P21941 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MATN1P21941 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MATN1P21941 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MATN1P21941 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MATN1P21941 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MATN1P21941 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MATN1P21941 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN1P21941 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN1P21941 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN1P21941 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN1P21941 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN1P21941 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN1P21941 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MATN1P21941 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN1P21941 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN1P21941 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN1P21941 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN1P21941 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN1P21941 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN1P21941 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MATN1P21941 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN1P21941 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN1P21941 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MATN1P21941 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MATN1P21941 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MATN1P21941 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MATN1P21941 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MATN1P21941 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MATN1P21941 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MATN1P21941 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MATN1P21941 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN1P21941 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN1P21941 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN1P21941 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN1P21941 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN1P21941 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN1P21941 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN1P21941 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MATN1P21941 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN1P21941 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN1P21941 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN1P21941 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN1P21941 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN1P21941 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN1P21941 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MATN1P21941 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN1P21941 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN1P21941 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN1P21941 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN1P21941 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN1P21941 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN1P21941 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MATN1P21941 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN1P21941 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN1P21941 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN1P21941 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN1P21941 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN1P21941 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN1P21941 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN1P21941 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN1P21941 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MATN1P21941 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN1P21941 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN1P21941 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN1P21941 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN1P21941 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN1P21941 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MATN1P21941 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN1P21941 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN1P21941 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN1P21941 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN1P21941 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN1P21941 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN1P21941 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN1P21941 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN1P21941 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MATN1P21941 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MATN1P21941 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MATN1P21941 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MATN1P21941 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MATN1P21941 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MATN1P21941 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MATN1P21941 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MATN1P21941 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MATN1P21941 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms