Protein–RNA interactions for Protein: P20962

PTMS, Parathymosin, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMSP20962 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTMSP20962 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTMSP20962 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTMSP20962 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTMSP20962 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTMSP20962 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTMSP20962 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTMSP20962 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTMSP20962 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTMSP20962 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTMSP20962 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTMSP20962 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTMSP20962 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTMSP20962 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTMSP20962 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTMSP20962 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTMSP20962 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTMSP20962 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTMSP20962 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTMSP20962 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTMSP20962 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTMSP20962 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTMSP20962 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTMSP20962 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTMSP20962 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTMSP20962 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTMSP20962 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTMSP20962 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTMSP20962 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTMSP20962 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTMSP20962 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTMSP20962 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTMSP20962 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTMSP20962 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTMSP20962 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTMSP20962 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTMSP20962 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTMSP20962 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTMSP20962 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTMSP20962 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTMSP20962 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTMSP20962 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTMSP20962 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTMSP20962 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTMSP20962 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTMSP20962 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTMSP20962 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTMSP20962 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTMSP20962 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTMSP20962 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTMSP20962 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTMSP20962 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTMSP20962 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTMSP20962 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTMSP20962 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PTMSP20962 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTMSP20962 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTMSP20962 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTMSP20962 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTMSP20962 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTMSP20962 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTMSP20962 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTMSP20962 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTMSP20962 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTMSP20962 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTMSP20962 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTMSP20962 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTMSP20962 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTMSP20962 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTMSP20962 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTMSP20962 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTMSP20962 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTMSP20962 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTMSP20962 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTMSP20962 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTMSP20962 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTMSP20962 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTMSP20962 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTMSP20962 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTMSP20962 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTMSP20962 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTMSP20962 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTMSP20962 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTMSP20962 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTMSP20962 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTMSP20962 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTMSP20962 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTMSP20962 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTMSP20962 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTMSP20962 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTMSP20962 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTMSP20962 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTMSP20962 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTMSP20962 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTMSP20962 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTMSP20962 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTMSP20962 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTMSP20962 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTMSP20962 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTMSP20962 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms