Protein–RNA interactions for Protein: P20424

SRP54, Signal recognition particle subunit SRP54, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP54P20424 CEM1YER061C 1329 nt7.58□□□□□ -1.2
SRP54P20424 CYB2YML054C 1776 nt7.57□□□□□ -1.2
SRP54P20424 YPL136WYPL136W 369 nt7.57□□□□□ -1.2
SRP54P20424 NUP84YDL116W 2181 nt7.56□□□□□ -1.2
SRP54P20424 GLN3YER040W 2193 nt7.56□□□□□ -1.2
SRP54P20424 GCG1YER163C 699 nt7.56□□□□□ -1.2
SRP54P20424 NTG1YAL015C 1200 nt7.56□□□□□ -1.2
SRP54P20424 ECM38YLR299W 1983 nt7.55□□□□□ -1.2
SRP54P20424 NAS6YGR232W 687 nt7.55□□□□□ -1.2
SRP54P20424 SPG1YGR236C 288 nt7.55□□□□□ -1.2
SRP54P20424 TUF1YOR187W 1314 nt7.54□□□□□ -1.2
SRP54P20424 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.54□□□□□ -1.2
SRP54P20424 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt7.54□□□□□ -1.2
SRP54P20424 MRPL23YOR150W 492 nt7.54□□□□□ -1.2
SRP54P20424 ASN2YGR124W 1719 nt7.53□□□□□ -1.2
SRP54P20424 TRS31YDR472W 852 nt7.53□□□□□ -1.2
SRP54P20424 CSM2YIL132C 642 nt7.53□□□□□ -1.2
SRP54P20424 YKR045CYKR045C 552 nt7.53□□□□□ -1.2
SRP54P20424 DRE2YKR071C 1047 nt7.53□□□□□ -1.2
SRP54P20424 IMD1YAR073W 1212 nt7.53□□□□□ -1.2
SRP54P20424 GPD2YOL059W 1323 nt7.52□□□□□ -1.2
SRP54P20424 QCR6YFR033C 444 nt7.52□□□□□ -1.21
SRP54P20424 SWD1YAR003W 1281 nt7.52□□□□□ -1.21
SRP54P20424 TSR2YLR435W 618 nt7.52□□□□□ -1.21
SRP54P20424 SNT309YPR101W 528 nt7.52□□□□□ -1.21
SRP54P20424 YLL066CYLL066C 3618 nt7.52□□□□□ -1.21
SRP54P20424 OSW2YLR054C 2175 nt7.52□□□□□ -1.21
SRP54P20424 MRPL28YDR462W 444 nt7.51□□□□□ -1.21
SRP54P20424 HXT2YMR011W 1626 nt7.5□□□□□ -1.21
SRP54P20424 RNH1YMR234W 1047 nt7.5□□□□□ -1.21
SRP54P20424 ERG8YMR220W 1356 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP54P20424 YDR187CYDR187C 519 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP54P20424 OM45YIL136W 1182 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP54P20424 CUE4YML101C 354 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP54P20424 YNL200CYNL200C 741 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP54P20424 ARC35YNR035C 1029 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP54P20424 OPI11YPR044C 354 nt7.49□□□□□ -1.21
SRP54P20424 AMN1YBR158W 1650 nt7.48□□□□□ -1.21
SRP54P20424 PAC2YER007W 1557 nt7.48□□□□□ -1.21
SRP54P20424 YSC83YHR017W 1158 nt7.48□□□□□ -1.21
SRP54P20424 MHT1YLL062C 975 nt7.48□□□□□ -1.21
SRP54P20424 TMA46YOR091W 1038 nt7.48□□□□□ -1.21
SRP54P20424 CDC1YDR182W 1476 nt7.48□□□□□ -1.21
SRP54P20424 BDF2YDL070W 1917 nt7.47□□□□□ -1.21
SRP54P20424 COQ1YBR003W 1422 nt7.47□□□□□ -1.21
SRP54P20424 AVT4YNL101W 2142 nt7.47□□□□□ -1.21
SRP54P20424 YMR034CYMR034C 1305 nt7.47□□□□□ -1.21
SRP54P20424 YHR020WYHR020W 2067 nt7.47□□□□□ -1.21
SRP54P20424 YOS9YDR057W 1629 nt7.46□□□□□ -1.21
SRP54P20424 YDL177CYDL177C 513 nt7.46□□□□□ -1.22
SRP54P20424 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt7.46□□□□□ -1.22
SRP54P20424 YLR463CYLR463C 552 nt7.46□□□□□ -1.22
SRP54P20424 YBR241CYBR241C 1467 nt7.46□□□□□ -1.22
SRP54P20424 HSP12YFL014W 330 nt7.45□□□□□ -1.22
SRP54P20424 YRB2YIL063C 984 nt7.45□□□□□ -1.22
SRP54P20424 YBR027CYBR027C 333 nt7.45□□□□□ -1.22
SRP54P20424 TAE1YBR261C 699 nt7.45□□□□□ -1.22
SRP54P20424 MCH2YKL221W 1422 nt7.44□□□□□ -1.22
SRP54P20424 PHO3YBR092C 1404 nt7.44□□□□□ -1.22
SRP54P20424 PPM2YOL141W 2088 nt7.44□□□□□ -1.22
SRP54P20424 ERS1YCR075C 783 nt7.44□□□□□ -1.22
SRP54P20424 HIS1YER055C 894 nt7.44□□□□□ -1.22
SRP54P20424 YPL041CYPL041C 624 nt7.44□□□□□ -1.22
SRP54P20424 RGD2YFL047W 2145 nt7.43□□□□□ -1.22
SRP54P20424 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt7.43□□□□□ -1.22
SRP54P20424 ERP2YAL007C 648 nt7.43□□□□□ -1.22
SRP54P20424 DID2YKR035W-A 615 nt7.43□□□□□ -1.22
SRP54P20424 YAR064WYAR064W 300 nt7.43□□□□□ -1.22
SRP54P20424 IRC11YOR013W 471 nt7.43□□□□□ -1.22
SRP54P20424 GSH1YJL101C 2037 nt7.42□□□□□ -1.22
SRP54P20424 STT3YGL022W 2157 nt7.42□□□□□ -1.22
SRP54P20424 RRP9YPR137W 1722 nt7.42□□□□□ -1.22
SRP54P20424 KNS1YLL019C 2214 nt7.42□□□□□ -1.22
SRP54P20424 MTR3YGR158C 753 nt7.42□□□□□ -1.22
SRP54P20424 YML018CYML018C 1182 nt7.42□□□□□ -1.22
SRP54P20424 CEF1YMR213W 1773 nt7.41□□□□□ -1.22
SRP54P20424 CCT8YJL008C 1707 nt7.41□□□□□ -1.22
SRP54P20424 DAL4YIR028W 1908 nt7.4□□□□□ -1.22
SRP54P20424 YBR284WYBR284W 2394 nt7.4□□□□□ -1.22
SRP54P20424 CUP2YGL166W 678 nt7.4□□□□□ -1.22
SRP54P20424 ARP3YJR065C 1350 nt7.4□□□□□ -1.22
SRP54P20424 YHK8YHR048W 1545 nt7.4□□□□□ -1.22
SRP54P20424 TDH2YJR009C 999 nt7.39□□□□□ -1.23
SRP54P20424 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.39□□□□□ -1.23
SRP54P20424 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.39□□□□□ -1.23
SRP54P20424 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.39□□□□□ -1.23
SRP54P20424 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.39□□□□□ -1.23
SRP54P20424 SUR7YML052W 909 nt7.39□□□□□ -1.23
SRP54P20424 YMR122CYMR122C 375 nt7.39□□□□□ -1.23
SRP54P20424 FYV1YDR024W 486 nt7.38□□□□□ -1.23
SRP54P20424 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.38□□□□□ -1.23
SRP54P20424 HEM2YGL040C 1029 nt7.38□□□□□ -1.23
SRP54P20424 COX10YPL172C 1389 nt7.37□□□□□ -1.23
SRP54P20424 MPC2YHR162W 390 nt7.37□□□□□ -1.23
SRP54P20424 GPH1YPR160W 2709 nt7.36□□□□□ -1.23
SRP54P20424 UIP5YKR044W 1332 nt7.36□□□□□ -1.23
SRP54P20424 snR82snR82 268 nt7.36□□□□□ -1.23
SRP54P20424 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.36□□□□□ -1.23
SRP54P20424 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.36□□□□□ -1.23
SRP54P20424 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.4 ms