Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP2B1P20020 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2B1P20020 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B1P20020 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B1P20020 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms