Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PDE6GP18545 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6GP18545 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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