Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA2P17301 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA2P17301 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA2P17301 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms