Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA3P15088 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA3P15088 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA3P15088 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA3P15088 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA3P15088 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA3P15088 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA3P15088 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA3P15088 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA3P15088 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA3P15088 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA3P15088 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA3P15088 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA3P15088 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA3P15088 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA3P15088 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA3P15088 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA3P15088 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA3P15088 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA3P15088 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA3P15088 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA3P15088 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPA3P15088 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA3P15088 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA3P15088 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA3P15088 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA3P15088 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA3P15088 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPA3P15088 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPA3P15088 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPA3P15088 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA3P15088 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA3P15088 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA3P15088 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPA3P15088 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA3P15088 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA3P15088 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA3P15088 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPA3P15088 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA3P15088 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA3P15088 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA3P15088 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA3P15088 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA3P15088 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA3P15088 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA3P15088 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA3P15088 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA3P15088 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA3P15088 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA3P15088 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA3P15088 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA3P15088 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA3P15088 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA3P15088 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPA3P15088 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPA3P15088 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPA3P15088 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPA3P15088 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA3P15088 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA3P15088 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA3P15088 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA3P15088 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA3P15088 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA3P15088 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA3P15088 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA3P15088 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA3P15088 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPA3P15088 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPA3P15088 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPA3P15088 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPA3P15088 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPA3P15088 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPA3P15088 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPA3P15088 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPA3P15088 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPA3P15088 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPA3P15088 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPA3P15088 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPA3P15088 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPA3P15088 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPA3P15088 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPA3P15088 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA3P15088 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA3P15088 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA3P15088 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA3P15088 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPA3P15088 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA3P15088 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA3P15088 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA3P15088 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA3P15088 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA3P15088 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA3P15088 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPA3P15088 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPA3P15088 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPA3P15088 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPA3P15088 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA3P15088 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA3P15088 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA3P15088 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms