Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GABRA1P14867 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRA1P14867 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA1P14867 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms