Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRFP11831 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRFP11831 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRFP11831 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRFP11831 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRFP11831 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRFP11831 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRFP11831 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRFP11831 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRFP11831 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRFP11831 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRFP11831 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRFP11831 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRFP11831 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRFP11831 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRFP11831 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRFP11831 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRFP11831 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRFP11831 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRFP11831 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRFP11831 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRFP11831 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRFP11831 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRFP11831 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SRFP11831 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRFP11831 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SRFP11831 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRFP11831 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRFP11831 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SRFP11831 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRFP11831 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRFP11831 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRFP11831 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRFP11831 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRFP11831 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRFP11831 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRFP11831 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRFP11831 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRFP11831 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRFP11831 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRFP11831 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SRFP11831 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRFP11831 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRFP11831 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRFP11831 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRFP11831 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRFP11831 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRFP11831 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRFP11831 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRFP11831 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRFP11831 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SRFP11831 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRFP11831 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRFP11831 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRFP11831 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRFP11831 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRFP11831 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRFP11831 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRFP11831 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRFP11831 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRFP11831 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SRFP11831 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SRFP11831 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRFP11831 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRFP11831 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRFP11831 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRFP11831 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRFP11831 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRFP11831 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRFP11831 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRFP11831 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRFP11831 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRFP11831 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRFP11831 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRFP11831 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRFP11831 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRFP11831 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRFP11831 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRFP11831 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRFP11831 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRFP11831 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRFP11831 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRFP11831 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRFP11831 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SRFP11831 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRFP11831 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRFP11831 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRFP11831 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRFP11831 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRFP11831 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRFP11831 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRFP11831 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRFP11831 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SRFP11831 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRFP11831 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRFP11831 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRFP11831 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SRFP11831 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SRFP11831 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRFP11831 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms