Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CETPP11597 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CETPP11597 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CETPP11597 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CETPP11597 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CETPP11597 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CETPP11597 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CETPP11597 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CETPP11597 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CETPP11597 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CETPP11597 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CETPP11597 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CETPP11597 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CETPP11597 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CETPP11597 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CETPP11597 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CETPP11597 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CETPP11597 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CETPP11597 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CETPP11597 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CETPP11597 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CETPP11597 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CETPP11597 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CETPP11597 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CETPP11597 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CETPP11597 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CETPP11597 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CETPP11597 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CETPP11597 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CETPP11597 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CETPP11597 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CETPP11597 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CETPP11597 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CETPP11597 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CETPP11597 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CETPP11597 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CETPP11597 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CETPP11597 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CETPP11597 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CETPP11597 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CETPP11597 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CETPP11597 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CETPP11597 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CETPP11597 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CETPP11597 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CETPP11597 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CETPP11597 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CETPP11597 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CETPP11597 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CETPP11597 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CETPP11597 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CETPP11597 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CETPP11597 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CETPP11597 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CETPP11597 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CETPP11597 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CETPP11597 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CETPP11597 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CETPP11597 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CETPP11597 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CETPP11597 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CETPP11597 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CETPP11597 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CETPP11597 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CETPP11597 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CETPP11597 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CETPP11597 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CETPP11597 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CETPP11597 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CETPP11597 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CETPP11597 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CETPP11597 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CETPP11597 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CETPP11597 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CETPP11597 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CETPP11597 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CETPP11597 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CETPP11597 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CETPP11597 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CETPP11597 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CETPP11597 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CETPP11597 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CETPP11597 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CETPP11597 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CETPP11597 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CETPP11597 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CETPP11597 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CETPP11597 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CETPP11597 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CETPP11597 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CETPP11597 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CETPP11597 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CETPP11597 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CETPP11597 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CETPP11597 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CETPP11597 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CETPP11597 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CETPP11597 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CETPP11597 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CETPP11597 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms