Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THRAP10827 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP10827 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP10827 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP10827 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP10827 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP10827 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP10827 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP10827 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP10827 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP10827 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
THRAP10827 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
THRAP10827 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THRAP10827 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THRAP10827 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THRAP10827 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THRAP10827 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THRAP10827 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP10827 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP10827 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP10827 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP10827 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP10827 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP10827 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRAP10827 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
THRAP10827 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP10827 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP10827 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP10827 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP10827 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP10827 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP10827 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP10827 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP10827 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP10827 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP10827 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP10827 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP10827 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP10827 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
THRAP10827 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
THRAP10827 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THRAP10827 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP10827 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP10827 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP10827 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP10827 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP10827 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP10827 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP10827 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP10827 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP10827 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP10827 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP10827 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP10827 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRAP10827 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRAP10827 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRAP10827 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP10827 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP10827 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRAP10827 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP10827 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP10827 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP10827 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP10827 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP10827 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP10827 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP10827 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRAP10827 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP10827 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP10827 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP10827 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP10827 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
THRAP10827 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
THRAP10827 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP10827 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP10827 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP10827 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP10827 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP10827 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP10827 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRAP10827 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THRAP10827 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THRAP10827 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP10827 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP10827 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRAP10827 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP10827 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP10827 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP10827 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP10827 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
THRAP10827 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRAP10827 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
THRAP10827 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRAP10827 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP10827 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP10827 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP10827 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP10827 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRAP10827 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP10827 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms