Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBSLP0DN79 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBSLP0DN79 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBSLP0DN79 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBSLP0DN79 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBSLP0DN79 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBSLP0DN79 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBSLP0DN79 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBSLP0DN79 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBSLP0DN79 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms