Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf88P0DMB2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C8orf88P0DMB2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf88P0DMB2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms