Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM17P0DL12 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM17P0DL12 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms