Protein–RNA interactions for Protein: P0CG36

CFC1B, Cryptic family protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1BP0CG36 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CFC1BP0CG36 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CFC1BP0CG36 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFC1BP0CG36 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms