Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
APOA4P06727 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
APOA4P06727 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOA4P06727 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOA4P06727 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOA4P06727 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOA4P06727 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOA4P06727 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOA4P06727 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOA4P06727 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOA4P06727 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOA4P06727 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOA4P06727 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOA4P06727 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APOA4P06727 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA4P06727 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA4P06727 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA4P06727 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA4P06727 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA4P06727 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA4P06727 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA4P06727 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA4P06727 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA4P06727 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA4P06727 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA4P06727 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOA4P06727 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOA4P06727 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOA4P06727 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOA4P06727 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOA4P06727 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOA4P06727 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
APOA4P06727 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOA4P06727 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOA4P06727 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOA4P06727 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOA4P06727 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOA4P06727 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA4P06727 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA4P06727 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA4P06727 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA4P06727 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA4P06727 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA4P06727 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA4P06727 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA4P06727 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA4P06727 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA4P06727 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA4P06727 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA4P06727 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA4P06727 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA4P06727 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOA4P06727 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOA4P06727 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOA4P06727 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOA4P06727 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOA4P06727 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOA4P06727 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA4P06727 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA4P06727 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA4P06727 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA4P06727 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA4P06727 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA4P06727 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA4P06727 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA4P06727 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA4P06727 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA4P06727 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA4P06727 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA4P06727 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA4P06727 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOA4P06727 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOA4P06727 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOA4P06727 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOA4P06727 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOA4P06727 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOA4P06727 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOA4P06727 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOA4P06727 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA4P06727 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA4P06727 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA4P06727 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA4P06727 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA4P06727 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA4P06727 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA4P06727 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA4P06727 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA4P06727 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA4P06727 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA4P06727 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA4P06727 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA4P06727 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA4P06727 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA4P06727 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA4P06727 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA4P06727 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA4P06727 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA4P06727 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA4P06727 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA4P06727 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms