Protein–RNA interactions for Protein: P06239

LCK, Tyrosine-protein kinase Lck, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCKP06239 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCKP06239 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCKP06239 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCKP06239 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCKP06239 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCKP06239 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCKP06239 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCKP06239 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCKP06239 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCKP06239 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCKP06239 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCKP06239 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCKP06239 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCKP06239 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCKP06239 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCKP06239 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCKP06239 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LCKP06239 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCKP06239 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCKP06239 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCKP06239 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCKP06239 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCKP06239 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCKP06239 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCKP06239 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LCKP06239 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCKP06239 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCKP06239 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCKP06239 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCKP06239 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCKP06239 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCKP06239 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCKP06239 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCKP06239 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCKP06239 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCKP06239 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCKP06239 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCKP06239 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCKP06239 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCKP06239 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCKP06239 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCKP06239 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCKP06239 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCKP06239 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCKP06239 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCKP06239 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCKP06239 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCKP06239 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCKP06239 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCKP06239 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCKP06239 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCKP06239 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCKP06239 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCKP06239 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCKP06239 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCKP06239 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCKP06239 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCKP06239 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCKP06239 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCKP06239 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LCKP06239 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCKP06239 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCKP06239 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCKP06239 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCKP06239 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCKP06239 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCKP06239 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCKP06239 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCKP06239 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCKP06239 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCKP06239 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCKP06239 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCKP06239 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCKP06239 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCKP06239 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCKP06239 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCKP06239 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCKP06239 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCKP06239 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCKP06239 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCKP06239 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCKP06239 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LCKP06239 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCKP06239 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCKP06239 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCKP06239 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCKP06239 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCKP06239 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCKP06239 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCKP06239 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCKP06239 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCKP06239 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCKP06239 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCKP06239 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCKP06239 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCKP06239 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCKP06239 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCKP06239 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCKP06239 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCKP06239 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms