Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPIND1P05546 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPIND1P05546 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SERPIND1P05546 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPIND1P05546 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms