Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCG5P05408 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG5P05408 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG5P05408 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG5P05408 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG5P05408 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCG5P05408 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG5P05408 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG5P05408 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG5P05408 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG5P05408 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG5P05408 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCG5P05408 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG5P05408 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG5P05408 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG5P05408 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG5P05408 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG5P05408 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCG5P05408 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCG5P05408 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCG5P05408 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCG5P05408 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCG5P05408 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCG5P05408 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG5P05408 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG5P05408 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG5P05408 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG5P05408 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG5P05408 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG5P05408 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG5P05408 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG5P05408 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG5P05408 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG5P05408 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG5P05408 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG5P05408 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG5P05408 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG5P05408 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG5P05408 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG5P05408 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG5P05408 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG5P05408 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG5P05408 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG5P05408 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG5P05408 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG5P05408 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG5P05408 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG5P05408 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG5P05408 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG5P05408 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG5P05408 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG5P05408 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG5P05408 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG5P05408 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG5P05408 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG5P05408 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG5P05408 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG5P05408 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG5P05408 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG5P05408 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG5P05408 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG5P05408 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG5P05408 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG5P05408 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG5P05408 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG5P05408 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCG5P05408 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG5P05408 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG5P05408 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG5P05408 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG5P05408 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG5P05408 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG5P05408 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG5P05408 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG5P05408 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG5P05408 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG5P05408 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG5P05408 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG5P05408 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG5P05408 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG5P05408 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG5P05408 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG5P05408 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG5P05408 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG5P05408 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG5P05408 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG5P05408 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG5P05408 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG5P05408 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG5P05408 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG5P05408 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG5P05408 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG5P05408 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG5P05408 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG5P05408 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG5P05408 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG5P05408 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG5P05408 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG5P05408 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG5P05408 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms