Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms