Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCGP05129 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKCGP05129 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKCGP05129 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCGP05129 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms