Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYCNP04198 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYCNP04198 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYCNP04198 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYCNP04198 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYCNP04198 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYCNP04198 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MYCNP04198 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYCNP04198 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYCNP04198 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYCNP04198 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYCNP04198 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYCNP04198 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MYCNP04198 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYCNP04198 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYCNP04198 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYCNP04198 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MYCNP04198 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYCNP04198 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYCNP04198 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MYCNP04198 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYCNP04198 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYCNP04198 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYCNP04198 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYCNP04198 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYCNP04198 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYCNP04198 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYCNP04198 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYCNP04198 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYCNP04198 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYCNP04198 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYCNP04198 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYCNP04198 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYCNP04198 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYCNP04198 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYCNP04198 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYCNP04198 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYCNP04198 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYCNP04198 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYCNP04198 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYCNP04198 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYCNP04198 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYCNP04198 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYCNP04198 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYCNP04198 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MYCNP04198 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MYCNP04198 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MYCNP04198 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYCNP04198 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYCNP04198 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYCNP04198 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYCNP04198 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYCNP04198 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYCNP04198 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYCNP04198 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYCNP04198 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MYCNP04198 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MYCNP04198 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYCNP04198 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYCNP04198 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYCNP04198 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYCNP04198 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYCNP04198 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYCNP04198 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MYCNP04198 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYCNP04198 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYCNP04198 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYCNP04198 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MYCNP04198 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYCNP04198 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYCNP04198 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYCNP04198 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYCNP04198 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYCNP04198 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYCNP04198 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYCNP04198 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MYCNP04198 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYCNP04198 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYCNP04198 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYCNP04198 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYCNP04198 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYCNP04198 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYCNP04198 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYCNP04198 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYCNP04198 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYCNP04198 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYCNP04198 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYCNP04198 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYCNP04198 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYCNP04198 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYCNP04198 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYCNP04198 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYCNP04198 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYCNP04198 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MYCNP04198 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYCNP04198 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYCNP04198 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYCNP04198 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MYCNP04198 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYCNP04198 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms