Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SERPINA1P01009 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA1P01009 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINA1P01009 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINA1P01009 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms