Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D2O95562 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D2O95562 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFT2D2O95562 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms