Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX6O95503 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX6O95503 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX6O95503 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX6O95503 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX6O95503 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX6O95503 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX6O95503 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX6O95503 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX6O95503 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX6O95503 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX6O95503 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX6O95503 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX6O95503 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBX6O95503 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBX6O95503 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBX6O95503 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBX6O95503 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX6O95503 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX6O95503 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX6O95503 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX6O95503 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX6O95503 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX6O95503 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX6O95503 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX6O95503 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX6O95503 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX6O95503 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX6O95503 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX6O95503 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX6O95503 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBX6O95503 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX6O95503 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX6O95503 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX6O95503 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CBX6O95503 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX6O95503 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX6O95503 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX6O95503 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX6O95503 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX6O95503 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX6O95503 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX6O95503 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX6O95503 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX6O95503 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX6O95503 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX6O95503 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX6O95503 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX6O95503 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX6O95503 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX6O95503 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX6O95503 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX6O95503 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX6O95503 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX6O95503 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX6O95503 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX6O95503 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX6O95503 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX6O95503 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX6O95503 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX6O95503 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX6O95503 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX6O95503 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX6O95503 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX6O95503 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX6O95503 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX6O95503 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX6O95503 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX6O95503 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX6O95503 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX6O95503 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBX6O95503 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBX6O95503 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBX6O95503 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBX6O95503 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBX6O95503 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBX6O95503 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX6O95503 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX6O95503 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX6O95503 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX6O95503 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX6O95503 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX6O95503 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX6O95503 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX6O95503 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX6O95503 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX6O95503 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX6O95503 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX6O95503 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX6O95503 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX6O95503 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX6O95503 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX6O95503 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX6O95503 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX6O95503 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX6O95503 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX6O95503 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX6O95503 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX6O95503 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX6O95503 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms