Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RHOBTB3O94955 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RHOBTB3O94955 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RHOBTB3O94955 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHOBTB3O94955 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms