Protein–RNA interactions for Protein: O75677

RFPL1, Ret finger protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL1O75677 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFPL1O75677 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL1O75677 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL1O75677 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL1O75677 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFPL1O75677 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL1O75677 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL1O75677 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL1O75677 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFPL1O75677 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL1O75677 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL1O75677 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL1O75677 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFPL1O75677 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL1O75677 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFPL1O75677 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFPL1O75677 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms