Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX3O75364 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX3O75364 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX3O75364 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX3O75364 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX3O75364 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX3O75364 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX3O75364 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITX3O75364 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITX3O75364 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITX3O75364 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITX3O75364 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITX3O75364 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITX3O75364 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PITX3O75364 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITX3O75364 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITX3O75364 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITX3O75364 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITX3O75364 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITX3O75364 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX3O75364 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX3O75364 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX3O75364 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX3O75364 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX3O75364 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX3O75364 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX3O75364 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX3O75364 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX3O75364 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX3O75364 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITX3O75364 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX3O75364 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX3O75364 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX3O75364 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX3O75364 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX3O75364 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX3O75364 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX3O75364 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX3O75364 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX3O75364 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX3O75364 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX3O75364 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX3O75364 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX3O75364 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX3O75364 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX3O75364 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITX3O75364 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITX3O75364 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PITX3O75364 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PITX3O75364 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PITX3O75364 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX3O75364 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX3O75364 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX3O75364 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX3O75364 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX3O75364 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX3O75364 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITX3O75364 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITX3O75364 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITX3O75364 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITX3O75364 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITX3O75364 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PITX3O75364 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX3O75364 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX3O75364 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX3O75364 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX3O75364 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX3O75364 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX3O75364 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX3O75364 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX3O75364 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX3O75364 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX3O75364 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX3O75364 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX3O75364 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX3O75364 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX3O75364 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX3O75364 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX3O75364 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX3O75364 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITX3O75364 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITX3O75364 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITX3O75364 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITX3O75364 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITX3O75364 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PITX3O75364 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX3O75364 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX3O75364 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PITX3O75364 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PITX3O75364 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITX3O75364 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITX3O75364 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITX3O75364 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PITX3O75364 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX3O75364 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX3O75364 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX3O75364 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX3O75364 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX3O75364 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PITX3O75364 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms