Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOL3O60936 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOL3O60936 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOL3O60936 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NOL3O60936 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOL3O60936 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOL3O60936 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOL3O60936 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOL3O60936 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOL3O60936 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOL3O60936 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOL3O60936 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOL3O60936 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOL3O60936 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOL3O60936 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOL3O60936 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOL3O60936 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOL3O60936 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOL3O60936 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOL3O60936 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOL3O60936 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOL3O60936 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOL3O60936 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOL3O60936 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOL3O60936 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOL3O60936 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NOL3O60936 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOL3O60936 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOL3O60936 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOL3O60936 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOL3O60936 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NOL3O60936 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOL3O60936 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOL3O60936 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOL3O60936 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOL3O60936 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOL3O60936 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOL3O60936 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOL3O60936 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOL3O60936 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NOL3O60936 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOL3O60936 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOL3O60936 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOL3O60936 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOL3O60936 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOL3O60936 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOL3O60936 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOL3O60936 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOL3O60936 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOL3O60936 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOL3O60936 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOL3O60936 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOL3O60936 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOL3O60936 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOL3O60936 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOL3O60936 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOL3O60936 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOL3O60936 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOL3O60936 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOL3O60936 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOL3O60936 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOL3O60936 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOL3O60936 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOL3O60936 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOL3O60936 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOL3O60936 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOL3O60936 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOL3O60936 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOL3O60936 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NOL3O60936 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOL3O60936 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOL3O60936 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOL3O60936 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOL3O60936 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOL3O60936 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOL3O60936 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOL3O60936 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOL3O60936 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOL3O60936 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOL3O60936 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOL3O60936 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOL3O60936 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOL3O60936 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOL3O60936 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOL3O60936 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOL3O60936 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOL3O60936 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOL3O60936 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOL3O60936 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NOL3O60936 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOL3O60936 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOL3O60936 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOL3O60936 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOL3O60936 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOL3O60936 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOL3O60936 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOL3O60936 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOL3O60936 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOL3O60936 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOL3O60936 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms