Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP9O43818 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP9O43818 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP9O43818 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP9O43818 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP9O43818 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP9O43818 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP9O43818 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP9O43818 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP9O43818 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRP9O43818 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRP9O43818 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRP9O43818 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP9O43818 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP9O43818 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP9O43818 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP9O43818 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP9O43818 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP9O43818 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP9O43818 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRP9O43818 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP9O43818 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RRP9O43818 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP9O43818 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP9O43818 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP9O43818 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP9O43818 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RRP9O43818 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP9O43818 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RRP9O43818 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP9O43818 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP9O43818 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP9O43818 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP9O43818 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP9O43818 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RRP9O43818 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RRP9O43818 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP9O43818 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP9O43818 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP9O43818 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RRP9O43818 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP9O43818 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP9O43818 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP9O43818 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RRP9O43818 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP9O43818 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP9O43818 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP9O43818 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RRP9O43818 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP9O43818 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP9O43818 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP9O43818 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RRP9O43818 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP9O43818 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP9O43818 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP9O43818 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP9O43818 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP9O43818 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP9O43818 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP9O43818 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP9O43818 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP9O43818 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP9O43818 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP9O43818 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP9O43818 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP9O43818 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP9O43818 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP9O43818 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP9O43818 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP9O43818 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP9O43818 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP9O43818 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP9O43818 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP9O43818 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP9O43818 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP9O43818 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP9O43818 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP9O43818 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP9O43818 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP9O43818 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP9O43818 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP9O43818 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP9O43818 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP9O43818 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP9O43818 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP9O43818 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP9O43818 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP9O43818 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP9O43818 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP9O43818 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP9O43818 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP9O43818 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP9O43818 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP9O43818 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP9O43818 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP9O43818 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRP9O43818 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP9O43818 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP9O43818 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP9O43818 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms