Protein–RNA interactions for Protein: O43508

TNFSF12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12O43508 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF12O43508 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF12O43508 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF12O43508 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms