Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBDO15205 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBDO15205 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBDO15205 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBDO15205 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBDO15205 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBDO15205 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBDO15205 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBDO15205 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBDO15205 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBDO15205 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBDO15205 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBDO15205 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBDO15205 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBDO15205 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBDO15205 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBDO15205 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBDO15205 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBDO15205 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBDO15205 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBDO15205 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBDO15205 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBDO15205 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBDO15205 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBDO15205 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBDO15205 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UBDO15205 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBDO15205 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBDO15205 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBDO15205 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBDO15205 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBDO15205 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UBDO15205 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBDO15205 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBDO15205 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBDO15205 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBDO15205 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBDO15205 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBDO15205 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBDO15205 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBDO15205 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBDO15205 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBDO15205 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBDO15205 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBDO15205 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBDO15205 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBDO15205 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBDO15205 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBDO15205 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBDO15205 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBDO15205 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBDO15205 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBDO15205 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBDO15205 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBDO15205 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBDO15205 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBDO15205 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBDO15205 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBDO15205 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBDO15205 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBDO15205 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBDO15205 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBDO15205 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBDO15205 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBDO15205 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBDO15205 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBDO15205 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBDO15205 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBDO15205 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBDO15205 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBDO15205 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBDO15205 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBDO15205 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBDO15205 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBDO15205 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBDO15205 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBDO15205 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBDO15205 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBDO15205 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBDO15205 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBDO15205 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBDO15205 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBDO15205 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBDO15205 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBDO15205 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBDO15205 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBDO15205 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBDO15205 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBDO15205 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBDO15205 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBDO15205 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBDO15205 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBDO15205 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBDO15205 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBDO15205 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBDO15205 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBDO15205 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBDO15205 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBDO15205 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBDO15205 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms